На территории лесов Гродненского ГПЛХО с целью сохранения ценных природных комплексов выделен ряд особо охраняемых природных территорий (ООПТ): 14 заказников республиканского значения, 42 заказника местного значения, 90 памятников природы республиканского значения, 132 памятников природы местного значения.
Существующие заказники представляют все наиболее значимые виды природных экосистем и их сочетаний.
Республиканские ландшафтные заказники:
«Свитязянский» (ГЛХУ «Новогрудский лесхоз», Площадь: 1193,79 га.),
«Озеры» (ГЛХУ «Гродненский лесхоз» — ГЛХУ «Скидельский лесхоз» , Площадь: 23870,9 га.),
«Новогрудский» (ГЛХУ «Новогрудский лесхоз», Площадь: 1697 га.),
«Сорочанские озера» (ГЛХУ «Островецкий лесхоз», Площадь: 13059 га.),
«Котра» (ГЛХУ «Щучинский лесхоз» — ГЛХУ «Лидский лесхоз» , Площадь: 10463,5 га.),
«Липичанская пуща» (ГЛХУ «Дятловский лесхоз» — ГЛХУ «Щучинский лесхоз» , Площадь: 15153 га.),
«Налибокский» (ГЛХУ «Ивьевский лесхоз» — ГЛХУ «Новогрудский лесхоз» , Площадь: 77540 га.),
«Гродненская пуща» (ГЛХУ «Гродненский лесхоз», Площадь: 20903 га.).
Образованы для сохранения ценных лесо-озерных ландшафтов, луговых комплексов.
Биологические заказники:
«Докудовский» (ГЛХУ «Лидский лесхоз», Площадь: 1984,6 га.),
«Дубатовское» (ГЛХУ «Сморгонский лесхоз», Площадь: 839,5 га.),
«Медухово» (ГЛХУ «Слонимский лесхоз», Площадь: 1312 га.),
«Замковый лес» (ГЛХУ «Волковысский лесхоз», Площадь: 3709 га.),
«Слонимский» (ГЛХУ «Слонимский лесхоз», Площадь: 4812,73 га.).
Созданы с целью сохранения естественных плантаций клюквы, дикорастущих лекарственных растений, редких и исчезающих видов растений и животных, ценных лесных формаций.
Гидрологический заказник:
«Миранка» (ГЛХУ «Новогрудский лесхоз», Площадь: 3107 га.).
Образован в целях стабилизации гидрологического режима рек Немана и Уши.
На территории выделенных особо-охраняемых территорий установлен специальный режим, который ограничивает не только проведение определенных видов работ в лесу и хозяйственную деятельности, но также ограничивает проведение рубок леса, передвижение автомобильного транспорта по лесам на территории заказников, установку палаток и оборудование мест отдыха, сбор дикорастущих растений и их плодов.